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网络分析研究实体之间的关系，如个人、组织或文件。在多个层面上操作，它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。
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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Basics of gene expression
Genes are nothing but regions of the DNA, and act as a repository of biological information, which is necessary to build and maintain an organism’s cells. It includes construction and regulation of proteins, as well as other molecules that ultimately determine the growth and functioning of the living organism and transfer genetic traits to next generation. This is termed as the central dogma of molecular biology. Entire DNA sequence of an organism do not play active role in cellular activities. In the case of the human genome, only $2-3 \%$ of the whole human DNA are functional. The functional part or the coding part of DNA is only responsible for protein synthesis. The rest of the DNA consists of noncoding regions, and does not encode for any protein. This DNA is sometimes referred to as “junk-DNA” or noncoding DNA. Recent research reveals that junk-DNA plays critical roles in controlling how cells, organs, and other tissues behave. The coding part of DNA, gene, decides the type of protein that will be produced within a cell. Protein synthesis takes place within the cell through the process of transcription and translation. In the transcription phase, a molecular complex called RNA polymerase-II creates a copy of a gene from the DNA to messenger RNA (mRNA) inside the nucleus. The mRNA travels from nucleus to the cytoplasm for protein synthesis, where it then binds with ribosome. Ribosome is a complex molecule based on ribosomal RNA (rRNA) and proteins. At the ribosome, mRNA is used as a blueprint for the production of a protein; this process is called translation. The mRNA moves along the protein synthesis site, i.e., ribosomes, with a set of three-nucleotides called codons. Transfer RNA (tRNA) provides a compatible anticodon and is hybridized onto the mRNA. Finally, the amino acids bound to the RNA form a polypeptide chain. This process continues until the translation process reaches a stop codon, which terminates the polypeptide synthesis. The entire process is called gene expression.
Traditional experimentation systems in molecular biology are capable of studying only a few genes in a single experiment. Moreover, for a traditional method, it is difficult to capture the dynamic behavior or the activities of a gene that is going on inside a cell. Advent of high-throughput technology makes it possible to generate expression profiles of large chunk of genes in different biological environment and time course. DNA microarray and most recently developed next generation sequencing (NGS) technology provides a convenient and effective platform for monitoring activity of thousands of genes simultaneously.
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Microarray data generation
Microarray is an indispensable technology in molecular biology that helps in assessing expression of a large number of genes under multiple conditions, such as time-series, tissue samples (e.g., normal versus cancerous tissues), and experimental conditions. With the help of microarray experiments, one can monitor, simultaneously, the expression levels of several genes at a genome scale. To gain better understanding of a gene and its behavior inside a cell, various patterns can be derived by analyzing the change in expression of the genes.
There are five major steps in performing a typical microarray experiment $^1$ :
- mRNA isolation: This step includes the isolation of RNA from the cells. Degradation of RNA in this step is monitored by RNA electrophoresis or a bioanalyzer using RNA integrity number (RIN) as a benchmark.
- cDNA synthesis: At the advent of this stage, RNA controls are added, which are used for controlling the synthesis of complementary DNA (cDNA). This synthesis is carried out with the help of oligo-dT or random primers. This step enables the process of reverse transcription.
- Amplification and labeling: cDNA, synthesized in the prior step is amplified using in vitro transcription. The main motive of this step is to acquire a cRNA, comprising biotinylated $\mathrm{C}$ and $\mathrm{U}$ nuclèotidess, ręquirèd in the lāter sstèps.
- cRNA fragmentation: In this step, cRNAs obtained from the previous step is cut into many fragments. The next step of hybridization is applied to these fragments after it is transferred onto the microarray chip.
- Hybridization: This is a step, which removes any kind of anomaly found in the previous step. This step is an amalgamation of many steps depending on reaction condition and structural properties, which would play a significant role in the outcome of the cDNA molecules. This step is carried out for controlling the consistency of the overall microarray performance.
- Staining: This step is applied after washing the outcome from the prior step, which removes those cRNA bound to the microarray surface. Staining helps in stabilizing the microarray data.
网络分析代考
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Basics of gene expression
基因只不过是 DNA 的区域，充当生物信息的存储库，这是构建和维持生物体细胞所必需的。它包括蛋白质的构建和调节，以及最终决定生物体生长和功能并将遗传特性传递给下一代的其他分子。这被称为分子生物学的中心法则。生物体的整个 DNA 序列在细胞活动中并不发挥积极作用。就人类基因组而言，只有2−3%整个人类 DNA 都具有功能。DNA的功能部分或编码部分仅负责蛋白质合成。其余的 DNA 由非编码区组成，不编码任何蛋白质。这种 DNA 有时被称为“垃圾 DNA”或非编码 DNA。最近的研究表明，垃圾 DNA 在控制细胞、器官和其他组织的行为方式方面发挥着关键作用。DNA 的编码部分，即基因，决定了细胞内将产生的蛋白质类型。蛋白质合成通过转录和翻译过程在细胞内发生。在转录阶段，一种称为 RNA 聚合酶-II 的分子复合物在细胞核内创建从 DNA 到信使 RNA (mRNA) 的基因拷贝。mRNA 从细胞核传播到细胞质以合成蛋白质，然后在细胞质中与核糖体结合。核糖体是一种基于核糖体 RNA (rRNA) 和蛋白质的复杂分子。在核糖体中，mRNA 被用作生产蛋白质的蓝图；这个过程称为翻译。mRNA沿着蛋白质合成位点移动，即核糖体，带有一组称为密码子的三核苷酸。转移 RNA (tRNA) 提供相容的反密码子并与 mRNA 杂交。最后，与 RNA 结合的氨基酸形成多肽链。该过程一直持续到翻译过程到达终止密码子为止，终止密码子终止多肽合成。整个过程称为基因表达。核糖体，带有一组称为密码子的三核苷酸。转移 RNA (tRNA) 提供相容的反密码子并与 mRNA 杂交。最后，与 RNA 结合的氨基酸形成多肽链。该过程一直持续到翻译过程到达终止密码子为止，终止密码子终止多肽合成。整个过程称为基因表达。核糖体，带有一组称为密码子的三核苷酸。转移 RNA (tRNA) 提供相容的反密码子并与 mRNA 杂交。最后，与 RNA 结合的氨基酸形成多肽链。该过程一直持续到翻译过程到达终止密码子为止，终止密码子终止多肽合成。整个过程称为基因表达。
分子生物学中的传统实验系统只能在单个实验中研究少数基因。此外，对于传统方法，很难捕捉到细胞内发生的基因的动态行为或活动。高通量技术的出现使得生成大块基因在不同生物环境和时间过程中的表达谱成为可能。DNA 微阵列和最近开发的下一代测序 (NGS) 技术为同时监测数千个基因的活动提供了一个方便有效的平台。
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Microarray data generation
微阵列是分子生物学中不可或缺的技术，有助于评估大量基因在多种条件下的表达，例如时间序列、组织样本（例如，正常组织与癌变组织）和实验条件。在微阵列实验的帮助下，人们可以同时监测基因组范围内多个基因的表达水平。为了更好地了解基因及其在细胞内的行为，可以通过分析基因表达的变化得出各种模式。
执行典型的微阵列实验有五个主要步骤1 :
- mRNA 分离：此步骤包括从细胞中分离 RNA。此步骤中 RNA 的降解由 RNA 电泳或使用 RNA 完整性数 (RIN) 作为基准的生物分析仪监测。
- cDNA 合成：在这个阶段的到来，添加了 RNA 控制，用于控制互补 DNA (cDNA) 的合成。这种合成是在 oligo-dT 或随机引物的帮助下进行的。此步骤启用逆转录过程。
- 扩增和标记：在先前步骤中合成的 cDNA 使用体外转录进行扩增。这一步的主要目的是获得一个 cRNA，包括生物素化的C和在核苷酸，在后面的步骤中需要。
- cRNA片段化：在这一步中，将上一步获得的cRNAs切割成许多片段。在将这些片段转移到微阵列芯片上后，对这些片段进行下一步杂交。
- 杂交：这是一个步骤，它消除了在上一步中发现的任何类型的异常。根据反应条件和结构特性，这一步是许多步骤的合并，这将在 cDNA 分子的结果中发挥重要作用。执行此步骤是为了控制整体微阵列性能的一致性。
- 染色：这一步是在清洗上一步的结果之后应用的，这会去除那些结合到微阵列表面的 cRNA。染色有助于稳定微阵列数据。
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金融工程代写
金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题，以及设计新的和创新的金融产品。
非参数统计代写
非参数统计指的是一种统计方法，其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型；这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。
广义线性模型代考
广义线性模型（GLM）归属统计学领域，是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。
术语 广义线性模型（GLM）通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归，以及方差分析和方差分析（仅含固定效应）。
有限元方法代写
有限元方法（FEM）是一种流行的方法，用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。
有限元是一种通用的数值方法，用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程（即一些边界值问题）。为了解决一个问题，有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分，称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的，它是通过构建对象的网格来实现的：用于求解的数值域，它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统，以模拟整个问题。然后，有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。
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随机分析代写
随机微积分是数学的一个分支，对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。
时间序列分析代写
随机过程，是依赖于参数的一组随机变量的全体，参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现，其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值（如1秒，5分钟，12小时，7天，1年），因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中，往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录，以得到其自身发展的规律。
回归分析代写
多元回归分析渐进（Multiple Regression Analysis Asymptotics）属于计量经济学领域，主要是一种数学上的统计分析方法，可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系，在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。
MATLAB代写
MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中，其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括：数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发，包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统，其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题，尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题，而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问，这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展，得到了许多用户的投入。在大学环境中，它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域，MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要，工具箱允许您学习和应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数（M 文件）的综合集合，可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。