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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|MY561

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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|MY561

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Clustering coefficient

Clustering coefficient $(\mathrm{cc})$ is a measure of affinity (likelihood), to which nodes in a network tends to create tightly connected group with each others. The tendency of likelihood of adjacent nodes in a network is higher in comparison to the nonadjacent nodes. There exists several alternatives [20], [10], [30] for defining clustering coefficient. Clemente et al. [5] generalized clustering coefficient measure for weighted and directed networks. Latapy et al. [19] and Opsahl [24] defined a new clustering coefficient measure for bipartite graph. However, among all, Watts and Strogatz [33] definitions of clustering coefficient is widely accepted. Furthermore, they introduced the concept of local and global, or network average clustering coefficient in their proposed approach. Local clustering coefficient $\left(\mathrm{CC}{v_i}\right)$ is the ratio of total number of edges that are present among the neighbors of a node $v_i$ to the total number of possible edges that could exist among the neighbors of $v_i$. Thus $\mathrm{CC}{v_i}$ for a directed graph is given as
$$
C C_{v_i}=\frac{\sum_{j=1}^{\left|N_{v_i}\right|} \lambda\left(v_i, v_j\right)}{\left|N_{v_i}\right|\left(\left|N_{v_i}\right|-1\right)}
$$
where, $\lambda\left(v_i, v_j\right)= \begin{cases}1, & \text { if }\left(v_i, v_j\right) \text { is connected, } \forall v_j \in N_{v_i}, i \neq j \ 0, & \text { otherwise. }\end{cases}$ $N_{v_i}=\left{v_k \mid e(i, k) \in \mathcal{E} \vee e(k, i) \in \mathcal{E}\right}$ is the set of adjacent nodes of $v_i$ in $\mathcal{V}$, and $\left|N_{v_i}\right|\left(\left|N_{v_j}\right|-1\right)$ is the total number of expected edges.
In the case of an undirected graph, the total number of expected edges will be $\frac{\left|N_{\varepsilon i}\right|\left(\left|N_{v_i}\right|-1\right)}{2}$, since $e(i, j)=e(j, i)$. Thus $C_{v_i}$ for an undirected graph can be represent as
$$
c c_{v_i}=\frac{2 \times \sum_{j=1}^{\left|N_{v_i}\right|} \lambda\left(v_i, v_j\right)}{\left|N_{v_i}\right|\left(\left|N_{v_i}\right|-1\right)} .
$$
The average (global) clustering coefficient [33] is the mean of $K$ local clustering coefficient. Therefore the global clustering coefficient for a graph $\mathcal{G}$ can be defined as
$$
\overline{C C}=\frac{\sum_{i=1}^{\mathcal{V}} \mathrm{CC}_{v_i}}{\mathcal{V}}
$$
where the range of $\overline{\mathrm{CC}}$ values lies within $0 \leq \overline{C C} \leq 1$.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Degree distribution

Degree distributions $\left(P_k\right)$ is the probability that a node chosen randomly has a degree $k$. Therefore, $P_k$ of a network is the fraction of nodes $(n)$ having degree $k\left(n_k\right)$. Assume a network with $n$ number of nodes and $n_k$ numbers of nodes having degree $k$, then, $P_k$ can be defined as follows:
$$
P_k=\frac{n_k}{n}
$$
For a large network with $\mathcal{V}$ nodes (where average degree $\langle k\rangle \ll$ $|\mathcal{V}|$ ), the degree distribution (4.8) approximately follows the Poisson distribution:
$$
P_k=e^{-\langle k\rangle} \frac{\langle k\rangle^k}{k !}
$$
Fig. 4.3 depicts the degree distribution of real-world networks, namely facebook, ca-GrQc, and ca-HepTh network. The degree distribution of real-world networks (like the Internet, social network, etc.) found to follow the power law (functional relationship) properties, which is defined as follows:
$$
P_k \sim k^{-\gamma}
$$
where $\gamma$ is a constant, and its value is bounded between 2 and 3.
Such a pattern is called a power law distribution, or a scalefree distribution, because the shape of the distribution does not change with scale (see Fig. 4.7).

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网络分析代考

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Clustering coefficient

聚类系数 (cc) 是亲和力 (可能性) 的度量,网络中的节点倾向于创建彼此紧密连接的组。与非相邻节点相 比,网络中相邻节点的可能性趋势更高。存在几种用于定义聚类系数的替代方法 [20]、[10]、[30]。克莱 门特等人。[5] 加权和定向网络的广义聚类系数度量。拉塔皮等人。[19] 和 Opsahl [24] 为二分图定义了一 种新的聚类系数度量。然而,其中,Watts 和 Strogatz [33] 对聚类系数的定义被广泛接受。此外,他们在 他们提出的方法中引入了局部和全局或网络平均聚类系数的概念。局部聚类系数 $\left(\mathrm{CC} v_i\right)$ 是节点的邻居中 存在的边总数的比率 $v_i$ 到可能存在于邻居之间的可能边的总数 $v_i$. 因此 $\mathrm{CC} v_i$ 对于有向图给出为
$$
C C_{v_i}=\frac{\sum_{j=1}^{\left|N_{v_i}\right|} \lambda\left(v_i, v_j\right)}{\left|N_{v_i}\right|\left(\left|N_{v_i}\right|-1\right)}
$$
在哪里, $\lambda\left(v_i, v_j\right)=\left{1, \quad\right.$ if $\left(v_i, v_j\right)$ is connected, $\forall v_j \in N_{v_i}, i \neq j 0, \quad$ otherwise. $\left.N_{-}\left{v_{-}\right}\right}=\backslash l e f t\left{v_{-} k \backslash m i d e(i, k) \backslash i n \backslash m a t h c a|{E} \backslash v e e ~ e(k, i) \backslash i n \backslash m a t h c a|{E} \backslash r i g h t\right}$ 是相邻节点的集合 $v_i$ 在 $\mathcal{V} ,$ 和 $\left|N_{v_i}\right|\left(\left|N_{v_j}\right|-1\right)$ 是预期边的总数。
在无向图的情况下,预期边的总数将是 $\frac{\left|N_{s i}\right|\left(\left|N_{v_i}\right|-1\right)}{2}$ ,自从 $e(i, j)=e(j, i)$. 因此 $C_{v_i}$ 对于无向图可以表 示为
$$
c c_{v_i}=\frac{2 \times \sum_{j=1}^{\left|N_{v_i}\right|} \lambda\left(v_i, v_j\right)}{\left|N_{v_i}\right|\left(\left|N_{v_i}\right|-1\right)} .
$$
平均 (全局) 聚类系数[33]是 $K$ 局部聚类系数。因此,图的全局聚类系数 $\mathcal{G}$ 可以定义为
$$
\overline{C C}=\frac{\sum_{i=1}^{\mathcal{V}} \mathrm{CC}_{v_i}}{\mathcal{V}}
$$
其中的范围 $\overline{\mathrm{CC}}$ 价值在于 $0 \leq \overline{C C} \leq 1$.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Degree distribution

学位分布 $\left(P_k\right)$ 是随机选择的节点具有度的概率 $k$. 所以, $P_k$ 网络的一部分是节点的一部分 $(n)$ 有学位 $k\left(n_k\right)$. 假设一个网络 $n$ 节点数和 $n_k$ 有度数的节点数 $k$ ,然后, $P_k$ 可以定义如下:
$$
P_k=\frac{n_k}{n}
$$
对于具有 $\mathcal{V}$ 节点 (其中平均度 $\langle k\rangle \ll|\mathcal{V}|$ ), 度分布 (4.8) 近似服从泊松分布:
$$
P_k=e^{-\langle k\rangle} \frac{\langle k\rangle^k}{k !}
$$
图 4.3 描绘了真实世界网络的度分布,即 facebook、ca-GrQc 和 ca-HepTh 网络。发现现实世界网络(如 互联网、社交网络等) 的度分布遵循幂律 (函数关系) 属性,其定义如下:
$$
P_k \sim k^{-\gamma}
$$
在哪里 $\gamma$ 是一个常数,其值介于 2 和 3 之间。
这种模式称为幂律分布或无标度分布,因为分布的形状不随标度变化(见图 4.7)。

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

R语言代写问卷设计与分析代写
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STATA代写机器学习/统计学习代写
SPSS代写计量经济学代写
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EXCEL代写深度学习代写
SQL代写各种数据建模与可视化代写

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CSE416a

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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Basic concepts

A graph [3] is a pictorial representation of a set of objects and their association with each other. The objects are popularly termed as nodes or vertices, and the associations are depicted using interconnections between pair of nodes, called edges. Mathematically, graphs are represented as a set of edges and vertices.
Definition 2.1.1 (Graph). A graph $\mathcal{G}$ is a pair of finite set of vertices and edges, $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E})$, such that $\mathcal{V}=\left{v_1, v_2, \cdots, v_n\right}$ and $\mathcal{E}=$ $\left{e_1, e_2, \cdots, e_m\right}$. An edge $e_k=\left(v_i, v_j\right)$ connects vertices $v_i$ and $v_j$.

In the graph (Fig. 2.1), $\mathcal{V}={A, B, C, D, E, F}$ and $\mathcal{E}={(A, B)$, $(B, C),(C, D),(C, E),(E, E),(E, F),(E, D),(F, B)}$, where edges are an unordered pair of nodes having interconnections among them. Graph $\mathcal{G}$ is termed as undirected graph. The node $E$ is connected with itself through loop edge. A graph without my loop structure is called a simple graph.

A graph with an ordered pair of nodes, where edges are associated with directions is called a directed graph or digraph.

Definition 2.1.2 (Directed graph). A directed graph $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E}$ ) is a set of vertices $\mathcal{V}$ and edges $\mathcal{E}$, such that, for any edge $\left(v_i, v_j\right)$ posses direction denoted by arrow. Unlike undirected graph, for any edge $v_i \rightarrow v_j$, the edge $\left(v_i, v_j\right) \neq\left(v_j, v_i\right)$. The node $v_i$ is called tail, and $v_j$ is referred to as head of the edge $v_i \rightarrow v_j$. For example, see Fig. 2.2.
Definition 2.1.3 (Path). A path is a sequence of distinct vertices that are connected by edges. In other words, given a set of vertices, $\left{v_1, v_2, \cdots, v_k\right} \in \mathcal{G}(\mathcal{V})$ is a path if for every pair of vertices $v_i$ and $v_{i+1}$ have an edge $\left(v_i, v_{i+1}\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E})$. However, in case of a directed graph, a directed path connects the sequence of vertices with the added restriction that all edges are oriented towards the same direction.

In a path, if sequences of vertices are not distinct, it is referred to as a walk.

Two nodes, $v_i$ and $v_j$, are reachable from each other if there is a path that exists between $v_i$ and $v_j$.

A path is called a closed path or cycle if two terminal nodes, $v_1$ and $v_k$, are connected in a path, i.e., $\left(v_k, v_1\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E})$.

In Fig. 2.1, $A-B-C-D$ or $A-B-F-E$ are two different paths, whereas $A \rightarrow B \rightarrow C \rightarrow D$ is a directed path existing in the directed graph (Fig. 2.2), but path $A \rightarrow B \rightarrow F \rightarrow E$ does not exist.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Data structure for representing graphs

The sequential representation of a graph using an array data structure uses a two-dimensional array or matrix called adjacency matrix.

Definition 2.2.1 (Adjacency matrix). Given a graph $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E}$ ), an adjacency matrix, say $A d j$ is a square matrix of size $|\mathcal{V}| \times|\mathcal{V}|$. Each cell of Adj indicates an edge between any two vertices or nodes:
$$
A d j[i][j]=\left{\begin{array}{cl}
\omega, & \text { if }\left(v_i, v_j\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E}) \
0, & \text { otherwise, }
\end{array}\right.
$$
where $\omega$ is the weight of the edge between the nodes $v_i$ and $v_j$. In the case of an unweighted graph, $\omega$ is considered as 1 , whereas for weighted graph it may be any value according to the problem in hand. See Fig. 2.10.

Adjacency matrices of undirected graphs are symmetric, where $A d j[i][j]=A d j[j][i]$, for $i, j$. In other words, we may say that $A d j$ and its transpose Adj’ is the same. Unlike undirected graph, digraph produces asymmetric matrix.
Finding degree of a node
One of the important operations on a graph is finding the degree of a given node. From the adjacency matrix, it is easy to determine the connection of any nodes. The degree of a node in an undirected graph can be calculated as follows:
$$
\operatorname{deg}\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j]
$$ where values in the $i^{t h}$ row in the adjacency matrix indicates the connections to $n$ different nodes from the node $i$ in the graph. Similarly, in the case of digraph, the indegree and outdegree of a node can be calculated as follows:
$$
\text { indeg }\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[j][i] \text { and outdeg }\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j] \text {. }
$$

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网络分析代考

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图 [3] 是一组对象及其相互关联的图形表示。这些对象通常称为节点或顶点,并且使用一对节点(称为 边) 之间的互连来描述关联。在数学上,图表示为一组边和顶点。
定义 2.1 .1 (图表)。一张图 $\mathcal{G}$ 是一对有限的顶点和边集, $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E})$ , 这样 $e_k=\left(v_i, v_j\right)$ 连接顶点 $v_i$ 和 $v_j$.
在图中 (图 2.1), $\mathcal{V}=A, B, C, D, E, F$ 和
$\mathcal{E}=(A, B) \$, \$(B, C),(C, D),(C, E),(E, E),(E, F),(E, D),(F, B)$ ,其中边是一对无序的 节点,它们之间有互连。图形 $\mathcal{G}$ 被称为无向图。节点 $E$ 通过循环边与自身相连。没有我的循环结构的图 称为简单图。
具有一对有序节点的图,其中边与方向相关联,称为有向图或有向图。
定义 2.1 .2 (有向图) 。有向图 $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E})$ 是一组顶点 $\mathcal{V}$ 和边缘 $\mathcal{E}$ ,这样,对于任何边缘 $\left(v_i, v_j\right)$ 具有箭 头指示的方向。与无向图不同,对于任意边 $v_i \rightarrow v_j$ ,边缘 $\left(v_i, v_j\right) \neq\left(v_j, v_i\right)$. 节点 $v_i$ 称为尾巴,并 且 $v_j$ 被称为边缘的头部 $v_i \rightarrow v_j$. 例如,见图 2.2。
定义 2.1.3 (路径) 。路径是由边连接的不同顶点序列。换句话说,给定一组顶点, 优势 $\left(v_i, v_{i+1}\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E})$. 然而,在有向图的情况下,有向路径连接顶点序列,并添加了所有边都朝向相 同方向的限制。
在一条路径中,如果顶点序列不明显,则称为行走。
两个节点, $v_i$ 和 $v_j$ ,如果之间存在一条路径,则彼此可达 $v_i$ 和 $v_j$.
如果有两个终端节点,则路径称为闭合路径或循环, $v_1$ 和 $v_k$ ,连接在一条路径上,即 $\left(v_k, v_1\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E})$.
在图 2.1 中, $A-B-C-D$ 或者 $A-B-F-E$ 是两条不同的路径,而 $A \rightarrow B \rightarrow C \rightarrow D$ 是 有向图中存在的有向路径 (图2.2),但路径 $A \rightarrow B \rightarrow F \rightarrow E$ 不存在。

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Data structure for representing graphs

使用数组数据结构的图的顺序表示使用称为邻接矩阵的二维数组或矩阵。
定义 2.2.1 (邻接矩阵) 。给定一个图 $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E}$ ),一个邻接矩阵, 比如 $A d j$ 是大小的方阵 $|\mathcal{V}| \times|\mathcal{V}|$. Adj 的每个单元表示任意两个顶点或节点之间的一条边: $\$ \$$
A dj $[i][j]=\backslash l e f t{$
$\omega, \quad$ if $\left(v_i, v_j\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E}) 0, \quad$ otherwise,
、止确的。 $\$ \$$
哪里 $\omega$ 是节点之间边的权重 $v_i$ 和 $v_j$. 在末加权图的情况下, $\omega$ 被认为是 1 ,而对于加权图,它可以是根据 手头问题的任何值。见图 2.10。
无向图的邻接矩阵是对称的,其中 $A d j[i][j]=A d j[j][i]$ ,为了 $i, j$. 换句话说,我们可以说 $A d j$ 并且 它的转置 Adj’ 是相同的。与无向图不同,有向图产生非对称矩阵。
查找节点的廂
图的重要操作之一是查找给定节点的度。从邻接矩阵中,很容易确定任意节点的连接。无向图中节点的 度可以计算如下:
$$
\operatorname{deg}\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j]
$$
其中值在 $i^{t h}$ 邻接矩阵中的行表示与 $n$ 来自节点的不同节点 $i$ 在图中。同样,在有向图的情况下,节点的入 度和出度可以计算如下:
$$
\operatorname{indeg}\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[j][i] \text { and outdeg }\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j] .
$$

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金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

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非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

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有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

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随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

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多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

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MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

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网络分析研究实体之间的关系,如个人、组织或文件。在多个层面上操作,它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。

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  • Advanced Probability Theory 高等概率论
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  • Foundations of Data Science 数据科学基础
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CS224W

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Technologies for network data production

The first pillar produces a lot of experimental data to gain insight into the properties of the systems, their properties, and dynamics. For instance, primary PPI data are produced in a wet lab by using different technological platforms. Technologies that enable the determination of protein interactions can be categorized in experiments investigating the presence of physical interactions, and experiments investigating kinetic constants of the reactions. Moreover, based on the number of the interacting partners revealed in a single assay, we can distinguish in technologies that characterize binary relations, such as yeast two-hybrid, and technologies elucidating multiple relations, such as mass spectrometry.

The experiments based on these technologies share a general schema, in which a so-called bait protein is used as a test to demonstrate its relations with one or more proteins preys. Both single interactions and exhaustive screenings have been realized following this schema. However, an interesting aspect is the reliability of discovered interactions. In particular, each assay can be evaluated on the basis of some ad hoc defined quality measurement.

Considering the human brain connectome of neural cells, the main technologies for data productions are brain imaging techniques, such as magnetic resonance imaging (MRI). Once images have been captured, a set of post-processing techniques are applied to analyze their content and derive brain graphs representing both static and dynamical aspects of the brain.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Network analysis models

The second pillar has introduced novel tools to build models starting from raw data, and to analyze such models to understand complex systems. Consequently, from a computational science point of view, the need for the introduction of methods and tools for data storage, representation, exchange, and analysis has led the research in such area.

Independent of any network specific application, the flow of data and analysis in this area of research follows standard structure. The process starts with the accumulation of a significant amount of data using high-throughput technologies, such as microarray or next generation sequencing in molecular biology or nuclear magnetic resonance in brain research. Data are then analyzed to build networks, starting from experimental data using network identification methods that result in the building of static or dynamics networks. Networks are mined to elucidate the organization of the biological elements on a system-level scale. Consequently, scientists try to investigate both the global and local organizational principles aiming to discover the difference between subjects or among the healthy and diseased state. After obtaining the networks, the need for the analysis and the comparison of networks of different subjects has led to the development of novel comparison algorithms based on graph and subgraph isomorphism [9].

In case of molecular interactions, after the wet-lab experiments, data are usually collected and preserved in databases [6]. Currently, there exist many publicly available databases that offer the user the possibility to retrieve data easily. Querying interfaces enables both the retrieval of simple information and a particular subnetwork (see Chapter 5 for a more detailed discussion). Many databases can be searched by inserting one or more protein identifiers. The output of such a query is a list of related proteins. Some recent databases offer a semantically more expressive language than simple interaction retrieval, whereas recent research directions are based on the use of a high-level language (e.g., using graph formalism), in suitable graph structures, and search for those by applying appropriate algorithms. Main challenges in this area are (i) expressiveness of the query language that should be able to capture biologically meaningful queries, (ii) efficiency and coverage of the retrieval method, and (iii) simplicity to capture and use results.

Among the others, one of the most used formalism to represent a set of items and their interaction comes from graph theory [4]. Consequently, the use of graphs and networks has become prevalent in many research fields interested in such analysis.

For example, in molecular biology and the so-called omics word, the use of networks for the representation of interactions among proteins is widely used [2], [1]. In interactomic field, proteins, i.e., the interactors, are represented as nodes, whose labels are the identifiers, whereas interactions among proteins are represented as edges linking nodes producing protein-protein interaction networks (PINs). The most straightforward representation uses undirected edges, whereas more refined models use directed and labeled edges to integrate the information about the kind of biochemical association and its direction. Analogously, networks have been largely used to represent the complex mechanism of regulation among genes, yielding to the introduction of gene regulatory networks (GRNs) [7]. In parallel, networks have also been used for the integration of heterogeneous data into a single model [5].

More recently, networks analysis are used in brain research to represent relations among different components of the brain [10]. Contrary to other fields of application, the modeling of the brain, also referred to as connectomics, presents many challenges, since graphs may be used using different scales of views. For instance, nodes may represent neurons and edge their axons, or nodes may be anatomical regions of the brain to understand brain functions and their modifications in case of disease (e.g., for early detection of diseases).

In this book, we consider three types of biological networks: gene expression networks, protein-protein interaction networks and brain connectome networks. We discuss in detail each network models, their properties, the process of generating them, and recent trends and tools in analyzing those networks with an objective to novel biological knowledge, unknown apriori.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CS224W

网络分析代考

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Technologies for network data production

第一个支柱产生大量实验数据,以深入了解系统的特性、它们的特性和动力学。例如,主要 PPI 数据是在湿实验室中使用不同的技术平台生成的。能够确定蛋白质相互作用的技术可以分为研究物理相互作用存在的实验和研究反应动力学常数的实验。此外,根据单次检测中显示的相互作用伙伴的数量,我们可以区分表征二元关系的技术,如酵母双杂交,以及阐明多重关系的技术,如质谱法。

基于这些技术的实验共享一个通用模式,其中使用所谓的诱饵蛋白作为测试来证明它与一种或多种蛋白质猎物的关系。单一交互和详尽放映都已按照此模式实现。然而,一个有趣的方面是发现的交互的可靠性。特别是,可以根据一些特别定义的质量测量来评估每个化验。

考虑到神经细胞的人脑连接组,数据生产的主要技术是脑成像技术,例如磁共振成像(MRI)。捕获图像后,将应用一组后处理技术来分析其内容并导出代表大脑静态和动态方面的大脑图。

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Network analysis models

第二个支柱引入了新的工具来从原始数据开始构建模型,并分析这些模型以理解复杂的系统。因此,从计算科学的角度来看,引入数据存储、表示、交换和分析的方法和工具的需求引领了该领域的研究。

独立于任何网络特定应用程序,该研究领域的数据流和分析遵循标准结构。该过程始于使用高通量技术积累大量数据,例如分子生物学中的微阵列或下一代测序或大脑研究中的核磁共振。然后分析数据以构建网络,从实验数据开始,使用网络识别方法构建静态或动态网络。挖掘网络是为了在系统级规模上阐明生物元素的组织。因此,科学家们试图研究全球和局部组织原则,旨在发现受试者之间或健康和患病状态之间的差异。获得网络后,

在分子相互作用的情况下,在湿实验室实验之后,通常会收集数据并将其保存在数据库中 [6]。目前,存在许多公开可用的数据库,它们为用户提供了轻松检索数据的可能性。查询接口既可以检索简单信息,也可以检索特定的子网(有关更详细的讨论,请参见第 5 章)。可以通过插入一个或多个蛋白质标识符来搜索许多数据库。这种查询的输出是相关蛋白质的列表。一些最近的数据库提供了一种比简单的交互检索在语义上更具表现力的语言,而最近的研究方向是基于使用高级语言(例如,使用图形式主义),在合适的图结构中,并通过应用适当的算法来搜索那些.

其中,最常用的表示一组项目及其交互的形式主义之一来自图论 [4]。因此,图和网络的使用在许多对此类分析感兴趣的研究领域中变得普遍。

例如,在分子生物学和所谓的组学词中,广泛使用网络来表示蛋白质之间的相互作用 [2]、[1]。在相互作用组学领域,蛋白质,即相互作用体,被表示为节点,其标签是标识符,而蛋白质之间的相互作用被表示为连接节点的边,产生蛋白质-蛋白质相互作用网络(PIN)。最直接的表示使用无向边,而更精细的模型使用有向和标记的边来整合有关生化关联类型及其方向的信息。类似地,网络已广泛用于表示基因间复杂的调控机制,从而引入基因调控网络 (GRN) [7]。在平行下,

最近,网络分析被用于大脑研究,以表示大脑不同组成部分之间的关​​系 [10]。与其他应用领域相反,大脑建模(也称为连接组学)提出了许多挑战,因为图表可能会使用不同比例的视图。例如,节点可以代表神经元并连接其轴突,或者节点可以是大脑的解剖区域,以了解大脑功能及其在疾病情况下的变化(例如,用于疾病的早期检测)。

在本书中,我们考虑了三种类型的生物网络:基因表达网络、蛋白质-蛋白质相互作用网络和脑连接组网络。我们详细讨论了每个网络模型、它们的属性、生成它们的过程,以及分析这些网络的最新趋势和工具,目的是获得新的生物学知识、未知的先验知识。

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

tatistics-lab作为专业的留学生服务机构,多年来已为美国、英国、加拿大、澳洲等留学热门地的学生提供专业的学术服务,包括但不限于Essay代写,Assignment代写,Dissertation代写,Report代写,小组作业代写,Proposal代写,Paper代写,Presentation代写,计算机作业代写,论文修改和润色,网课代做,exam代考等等。写作范围涵盖高中,本科,研究生等海外留学全阶段,辐射金融,经济学,会计学,审计学,管理学等全球99%专业科目。写作团队既有专业英语母语作者,也有海外名校硕博留学生,每位写作老师都拥有过硬的语言能力,专业的学科背景和学术写作经验。我们承诺100%原创,100%专业,100%准时,100%满意。

随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CSCl5352

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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Basics of gene expression

Genes are nothing but regions of the DNA, and act as a repository of biological information, which is necessary to build and maintain an organism’s cells. It includes construction and regulation of proteins, as well as other molecules that ultimately determine the growth and functioning of the living organism and transfer genetic traits to next generation. This is termed as the central dogma of molecular biology. Entire DNA sequence of an organism do not play active role in cellular activities. In the case of the human genome, only $2-3 \%$ of the whole human DNA are functional. The functional part or the coding part of DNA is only responsible for protein synthesis. The rest of the DNA consists of noncoding regions, and does not encode for any protein. This DNA is sometimes referred to as “junk-DNA” or noncoding DNA. Recent research reveals that junk-DNA plays critical roles in controlling how cells, organs, and other tissues behave. The coding part of DNA, gene, decides the type of protein that will be produced within a cell. Protein synthesis takes place within the cell through the process of transcription and translation. In the transcription phase, a molecular complex called RNA polymerase-II creates a copy of a gene from the DNA to messenger RNA (mRNA) inside the nucleus. The mRNA travels from nucleus to the cytoplasm for protein synthesis, where it then binds with ribosome. Ribosome is a complex molecule based on ribosomal RNA (rRNA) and proteins. At the ribosome, mRNA is used as a blueprint for the production of a protein; this process is called translation. The mRNA moves along the protein synthesis site, i.e., ribosomes, with a set of three-nucleotides called codons. Transfer RNA (tRNA) provides a compatible anticodon and is hybridized onto the mRNA. Finally, the amino acids bound to the RNA form a polypeptide chain. This process continues until the translation process reaches a stop codon, which terminates the polypeptide synthesis. The entire process is called gene expression.

Traditional experimentation systems in molecular biology are capable of studying only a few genes in a single experiment. Moreover, for a traditional method, it is difficult to capture the dynamic behavior or the activities of a gene that is going on inside a cell. Advent of high-throughput technology makes it possible to generate expression profiles of large chunk of genes in different biological environment and time course. DNA microarray and most recently developed next generation sequencing (NGS) technology provides a convenient and effective platform for monitoring activity of thousands of genes simultaneously.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Microarray data generation

Microarray is an indispensable technology in molecular biology that helps in assessing expression of a large number of genes under multiple conditions, such as time-series, tissue samples (e.g., normal versus cancerous tissues), and experimental conditions. With the help of microarray experiments, one can monitor, simultaneously, the expression levels of several genes at a genome scale. To gain better understanding of a gene and its behavior inside a cell, various patterns can be derived by analyzing the change in expression of the genes.

There are five major steps in performing a typical microarray experiment $^1$ :

  • mRNA isolation: This step includes the isolation of RNA from the cells. Degradation of RNA in this step is monitored by RNA electrophoresis or a bioanalyzer using RNA integrity number (RIN) as a benchmark.
  • cDNA synthesis: At the advent of this stage, RNA controls are added, which are used for controlling the synthesis of complementary DNA (cDNA). This synthesis is carried out with the help of oligo-dT or random primers. This step enables the process of reverse transcription.
  • Amplification and labeling: cDNA, synthesized in the prior step is amplified using in vitro transcription. The main motive of this step is to acquire a cRNA, comprising biotinylated $\mathrm{C}$ and $\mathrm{U}$ nuclèotidess, ręquirèd in the lāter sstèps.
  • cRNA fragmentation: In this step, cRNAs obtained from the previous step is cut into many fragments. The next step of hybridization is applied to these fragments after it is transferred onto the microarray chip.
  • Hybridization: This is a step, which removes any kind of anomaly found in the previous step. This step is an amalgamation of many steps depending on reaction condition and structural properties, which would play a significant role in the outcome of the cDNA molecules. This step is carried out for controlling the consistency of the overall microarray performance.
  • Staining: This step is applied after washing the outcome from the prior step, which removes those cRNA bound to the microarray surface. Staining helps in stabilizing the microarray data.
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CSCl5352

网络分析代考

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Basics of gene expression

基因只不过是 DNA 的区域,充当生物信息的存储库,这是构建和维持生物体细胞所必需的。它包括蛋白质的构建和调节,以及最终决定生物体生长和功能并将遗传特性传递给下一代的其他分子。这被称为分子生物学的中心法则。生物体的整个 DNA 序列在细胞活动中并不发挥积极作用。就人类基因组而言,只有2−3%整个人类 DNA 都具有功能。DNA的功能部分或编码部分仅负责蛋白质合成。其余的 DNA 由非编码区组成,不编码任何蛋白质。这种 DNA 有时被称为“垃圾 DNA”或非编码 DNA。最近的研究表明,垃圾 DNA 在控制细胞、器官和其他组织的行为方式方面发挥着关键作用。DNA 的编码部分,即基因,决定了细胞内将产生的蛋白质类型。蛋白质合成通过转录和翻译过程在细胞内发生。在转录阶段,一种称为 RNA 聚合酶-II 的分子复合物在细胞核内创建从 DNA 到信使 RNA (mRNA) 的基因拷贝。mRNA 从细胞核传播到细胞质以合成蛋白质,然后在细胞质中与核糖体结合。核糖体是一种基于核糖体 RNA (rRNA) 和蛋白质的复杂分子。在核糖体中,mRNA 被用作生产蛋白质的蓝图;这个过程称为翻译。mRNA沿着蛋白质合成位点移动,即核糖体,带有一组称为密码子的三核苷酸。转移 RNA (tRNA) 提供相容的反密码子并与 mRNA 杂交。最后,与 RNA 结合的氨基酸形成多肽链。该过程一直持续到翻译过程到达终止密码子为止,终止密码子终止多肽合成。整个过程称为基因表达。核糖体,带有一组称为密码子的三核苷酸。转移 RNA (tRNA) 提供相容的反密码子并与 mRNA 杂交。最后,与 RNA 结合的氨基酸形成多肽链。该过程一直持续到翻译过程到达终止密码子为止,终止密码子终止多肽合成。整个过程称为基因表达。核糖体,带有一组称为密码子的三核苷酸。转移 RNA (tRNA) 提供相容的反密码子并与 mRNA 杂交。最后,与 RNA 结合的氨基酸形成多肽链。该过程一直持续到翻译过程到达终止密码子为止,终止密码子终止多肽合成。整个过程称为基因表达。

分子生物学中的传统实验系统只能在单个实验中研究少数基因。此外,对于传统方法,很难捕捉到细胞内发生的基因的动态行为或活动。高通量技术的出现使得生成大块基因在不同生物环境和时间过程中的表达谱成为可能。DNA 微阵列和最近开发的下一代测序 (NGS) 技术为同时监测数千个基因的活动提供了一个方便有效的平台。

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Microarray data generation

微阵列是分子生物学中不可或缺的技术,有助于评估大量基因在多种条件下的表达,例如时间序列、组织样本(例如,正常组织与癌变组织)和实验条件。在微阵列实验的帮助下,人们可以同时监测基因组范围内多个基因的表达水平。为了更好地了解基因及其在细胞内的行为,可以通过分析基因表达的变化得出各种模式。

执行典型的微阵列实验有五个主要步骤1 :

  • mRNA 分离:此步骤包括从细胞中分离 RNA。此步骤中 RNA 的降解由 RNA 电泳或使用 RNA 完整性数 (RIN) 作为基准的生物分析仪监测。
  • cDNA 合成:在这个阶段的到来,添加了 RNA 控制,用于控制互补 DNA (cDNA) 的合成。这种合成是在 oligo-dT 或随机引物的帮助下进行的。此步骤启用逆转录过程。
  • 扩增和标记:在先前步骤中合成的 cDNA 使用体外转录进行扩增。这一步的主要目的是获得一个 cRNA,包括生物素化的C和在核苷酸,在后面的步骤中需要。
  • cRNA片段化:在这一步中,将上一步获得的cRNAs切割成许多片段。在将这些片段转移到微阵列芯片上后,对这些片段进行下一步杂交。
  • 杂交:这是一个步骤,它消除了在上一步中发现的任何类型的异常。根据反应条件和结构特性,这一步是许多步骤的合并,这将在 cDNA 分子的结果中发挥重要作用。执行此步骤是为了控制整体微阵列性能的一致性。
  • 染色:这一步是在清洗上一步的结果之后应用的,这会去除那些结合到微阵列表面的 cRNA。染色有助于稳定微阵列数据。
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金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

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非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

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广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

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  • Longitudinal Data Analysis 纵向数据分析
  • Foundations of Data Science 数据科学基础
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|ESS2022

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|General purpose repository of networks

The Stanford network analysis platform (SNAP) [20], is a general-purpose system for analysis and management of networks that is freely available through a website http://snap.stanford.edu/. SNAP is implemented in different languages, such as $\mathrm{C}++$ and Python. It offers over 140 different graph algorithms that can efficiently manipulate large graphs, calculate structural properties, generate rẻgular and random graphs, and handle attributes and metadata on nodes and edges.

An important part of SNAP is the network dataset collection [19] that contains more than 80 different social and information real-world networks and datasets. Networks models many domains, such as biological networks, social networks, citation and collaboration networks, as well as Web and media networks.

Table $5.3$ gives the types of datasets in the collection. The datasets are collected as part of our research in the past and, in that sense, represent typical graphs being analyzed. It gives the distribution of graph sizes in the collection. It can be observed that a vast majority of graphs are relatively small, with less than 100 million edges, thus can easily be analyzed in SNAP.NetworkRepository $(\mathrm{NR})^{18}[25]$ is a data repository for a network of different types (e.g., brain networks, social networks, etc.) available through a web-based platform. It stores more than 1000 various systems, and it also provides interactive visual analysis and an interactive graph analytics platform. Therefore the user of this database can manage, visualize networks, as well as analyze single systems or compare multiple networks using network statistics. NR also enables collaboration among users by allowing the users to discuss datasets, and to make a correction on data and analytics. The social aspect of NetworkRepository is a unique characteristic among others.

Biological networks produced by experimental platforms are stored into different databases. Such data are the essential building block for all the subsequent analysis tasks. Therefore the characteristics of such data storage systems may dramatically impact the performances of the subsequent steps.

Initially, many different groups used classic storage systems based on the relational model or simply flat files. Despite the simplicity, it has been shown that both relational and flat file model present many limitations related to speed and querying capabilities. Therefore, the growth of No-SQL databases has offered the possibility to use such systems even in network storage. Here we surveyed main approaches and some related experiences. More specifically we discussed and reported few network data sources available for analyzing genetic, proteomics and brain connectome networks. We even discussed few large scale social network data sources which may help other network researchers too.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Expression network and analysis: the workflow

Gene expression has become very essential in system-level understanding of behavior of genes. High-throughput microarray and next generation sequencing (NGS) technology makes available a large repository of expression data. It allow us to study the dynamic behavior of a gene inside a cell. Reverse engineering is a promising area of research in systems biology; it aims to recreate the cellular system for better understanding of biological mechanism. The development of a suitable reverse engineering method is important to get insight into the gene-gene relationships. Study of such data may enable us to address various issues, such as how a gene participates in a cellular process; what are the activities of different genes; in which cell and under which conditions, do the genes become active; how the activity of a gene is influenced by various diseases or drugs, and how genes contribute to diseases. One of the major goals in analyzing expression data is to determine how the expression of any particular gene may affect the expression of other genes or how one gene regulates another gene. Gene-gene relationships can be described through biological pathways, which can be represented as networks, broadly classified [66] as metabolic pathways, signal transduction pathways, and gene regulatory networks. The most preliminary network is the gene coexpression network, which describes certain association among genes.

Genes that affect one another may belong to the same gene network. A gene network is a set of related genes, where expression of one gene may influence the other gene’s activity. A group of co-regulated genes may form gene clusters that can encode proteins, which interact amongst themselves and take part in common biological processes. In silico reconstruction of such biological networks is essential for exploring regulatory mechanisms and is useful in better understanding of the cellular environment to investigate complex interactions [43]. In an organism, coexpression of genes depend on their sharing of the regulatory mechanism. It has been observed that genes with similar expression profiles are very likely to be regulators of one another, or be regulated by some other common parent gene [26]. Another major goal of expression data analysis is to determine what genes are over-expressed or underexpressed as a result of certain biological conditions, such as, what genes are expressed in diseased cells that are not expressed in normal cells. Recently, it has been observed that a small set of genes are coregulated and coexpressed under certain conditions, and their behavior being almost inactive for rest of the conditions. Discovering a group of genes with similar or inverted expression profiles has been employed to identify coexpressed group of genes (termed as modules), as well as to extract gene interactions or gene regulatory networks [66]. Isolating well-connected genes within the module using various topological analysis of the subnetwork may help in identifying disease-related biomarkers or essential disease genes. Once important genes can be identified, further investigation in identifying small chemical molecule modulator for binding overexpressed key genes in disease condition may produce effective drug target. At the end of the day, all the tasks performed in silico should be verified biologically in a wet lab environment before final consideration. A possible workflow of overall gene expression inference and analysis for disease diagnosis and biomarker identification is depicted in Fig. 6.1. It is important to mention here that the steps shown in the figure may not be fixed and subject to variation, depending on the methodology adopted.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|ESS2022

网络分析代考

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|General purpose repository of networks

斯坦福网络分析平台 (SNAP) [20] 是一个用于分析和管理网络的通用系统,可通过网站 http://snap.stanford.edu/ 免费获得。SNAP 以不同的语言实现,例如C++和蟒蛇。它提供了 140 多种不同的图形算法,可以有效地操作大型图形、计算结构属性、生成规则和随机图形,以及处理节点和边上的属性和元数据。

SNAP 的一个重要部分是网络数据集集合 [19],其中包含 80 多个不同的社会和信息真实世界网络和数据集。网络对许多领域建模,例如生物网络、社交网络、引用和协作网络,以及 Web 和媒体网络。

桌子5.3给出集合中数据集的类型. 数据集是作为我们过去研究的一部分收集的,从这个意义上说,它们代表了正在分析的典型图表。它给出了集合中图形大小的分布。可以观察到绝大多数图都比较小,边数少于 1 亿条,因此可以很容易地在 SNAP.NetworkRepository 中进行分析(否R)18[25]是通过基于网络的平台可用的不同类型网络(例如,大脑网络、社交网络等)的数据存储库。它存储了1000多个各种系统,还提供交互式可视化分析和交互式图形分析平台。因此,该数据库的用户可以管理、可视化网络,以及分析单个系统或使用网络统计数据比较多个网络。NR 还允许用户讨论数据集以及对数据和分析进行更正,从而实现用户之间的协作。NetworkRepository 的社会方面是其中的一个独特特征。

实验平台产生的生物网络存储在不同的数据库中。这些数据是所有后续分析任务的基本组成部分。因此,此类数据存储系统的特性可能会显着影响后续步骤的性能。

最初,许多不同的组使用基于关系模型或简单的平面文件的经典存储系统。尽管简单,但事实证明,关系模型和平面文件模型都存在许多与速度和查询功能相关的限制。因此,No-SQL 数据库的发展提供了在网络存储中使用此类系统的可能性。在这里,我们调查了主要方法和一些相关经验。更具体地说,我们讨论并报告了一些可用于分析遗传、蛋白质组学和脑连接组网络的网络数据源。我们甚至讨论了一些可能对其他网络研究人员也有帮助的大型社交网络数据源。

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Expression network and analysis: the workflow

基因表达在对基因行为的系统级理解中变得非常重要。高通量微阵列和下一代测序 (NGS) 技术提供了一个大型的表达数据存储库。它使我们能够研究细胞内基因的动态行为。逆向工程是系统生物学中一个很有前途的研究领域;它旨在重建细胞系统以更好地理解生物机制。开发合适的逆向工程方法对于深入了解基因-基因关系非常重要。对此类数据的研究可能使我们能够解决各种问题,例如基因如何参与细胞过程;不同基因的活动是什么;基因在哪个细胞中以及在何种条件下变得活跃;基因的活性如何受到各种疾病或药物的影响,以及基因如何导致疾病。分析表达数据的主要目标之一是确定任何特定基因的表达如何影响其他基因的表达或一个基因如何调节另一个基因。基因-基因关系可以通过生物通路来描述,生物通路可以表示为网络,大致分为[66]代谢通路、信号转导通路和基因调控网络。最初步的网络是基因共表达网络,它描述了基因之间的某种关联。分析表达数据的主要目标之一是确定任何特定基因的表达如何影响其他基因的表达或一个基因如何调节另一个基因。基因-基因关系可以通过生物通路来描述,生物通路可以表示为网络,大致分为[66]代谢通路、信号转导通路和基因调控网络。最初步的网络是基因共表达网络,它描述了基因之间的某种关联。分析表达数据的主要目标之一是确定任何特定基因的表达如何影响其他基因的表达或一个基因如何调节另一个基因。基因-基因关系可以通过生物通路来描述,生物通路可以表示为网络,大致分为[66]代谢通路、信号转导通路和基因调控网络。最初步的网络是基因共表达网络,它描述了基因之间的某种关联。

相互影响的基因可能属于同一个基因网络。基因网络是一组相关基因,其中一个基因的表达可能影响另一个基因的活性。一组共同调节的基因可能形成可以编码蛋白质的基因簇,这些蛋白质相互作用并参与共同的生物过程。这种生物网络的计算机重建对于探索调节机制至关重要,并且有助于更好地了解细胞环境以研究复杂的相互作用 [43]。在生物体中,基因的共表达取决于它们共享调节机制。据观察,具有相似表达谱的基因很可能是彼此的调节因子,或受某些其他共同亲本基因的调节 [26]。表达数据分析的另一个主要目标是确定哪些基因由于某些生物条件而过度表达或表达不足,例如,哪些基因在患病细胞中表达,而在正常细胞中不表达。最近,已经观察到一小部分基因在某些条件下被协同调节和共表达,并且它们的行为在其余条件下几乎不活跃。发现一组具有相似或反向表达谱的基因已被用于识别共表达的基因组(称为模块),以及提取基因相互作用或基因调控网络 [66]。使用子网络的各种拓扑分析分离模块内连接良好的基因可能有助于识别与疾病相关的生物标志物或基本疾病基因。一旦确定了重要基因,进一步研究确定小化学分子调节剂以结合疾病状况中过表达的关键基因可能会产生有效的药物靶点。归根结底,在最终考虑之前,应在潮湿的实验室环境中对计算机执行的所有任务进行生物学验证。用于疾病诊断和生物标志物鉴定的整体基因表达推断和分析的可能工作流程如图6.1所示。重要的是要在这里提到,图中所示的步骤可能不是固定的,可能会有所变化,具体取决于所采用的方法。在最终考虑之前,应在湿实验室环境中对在计算机中执行的所有任务进行生物学验证。用于疾病诊断和生物标志物鉴定的整体基因表达推断和分析的可能工作流程如图6.1所示。重要的是要在这里提到,图中所示的步骤可能不是固定的,可能会有所变化,具体取决于所采用的方法。在最终考虑之前,应在湿实验室环境中对在计算机中执行的所有任务进行生物学验证。用于疾病诊断和生物标志物鉴定的整体基因表达推断和分析的可能工作流程如图6.1所示。重要的是要在这里提到,图中所示的步骤可能不是固定的,可能会有所变化,具体取决于所采用的方法。

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

tatistics-lab作为专业的留学生服务机构,多年来已为美国、英国、加拿大、澳洲等留学热门地的学生提供专业的学术服务,包括但不限于Essay代写,Assignment代写,Dissertation代写,Report代写,小组作业代写,Proposal代写,Paper代写,Presentation代写,计算机作业代写,论文修改和润色,网课代做,exam代考等等。写作范围涵盖高中,本科,研究生等海外留学全阶段,辐射金融,经济学,会计学,审计学,管理学等全球99%专业科目。写作团队既有专业英语母语作者,也有海外名校硕博留学生,每位写作老师都拥有过硬的语言能力,专业的学科背景和学术写作经验。我们承诺100%原创,100%专业,100%准时,100%满意。

随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

R语言代写问卷设计与分析代写
PYTHON代写回归分析与线性模型代写
MATLAB代写方差分析与试验设计代写
STATA代写机器学习/统计学习代写
SPSS代写计量经济学代写
EVIEWS代写时间序列分析代写
EXCEL代写深度学习代写
SQL代写各种数据建模与可视化代写

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CS224

如果你也在 怎样代写网络分析Network Analysis这个学科遇到相关的难题,请随时右上角联系我们的24/7代写客服。

网络分析研究实体之间的关系,如个人、组织或文件。在多个层面上操作,它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。

statistics-lab™ 为您的留学生涯保驾护航 在代写网络分析Network Analysis方面已经树立了自己的口碑, 保证靠谱, 高质且原创的统计Statistics代写服务。我们的专家在代写网络分析Network Analysis代写方面经验极为丰富,各种代写网络分析Network Analysis相关的作业也就用不着说。

我们提供的网络分析Network Analysis及其相关学科的代写,服务范围广, 其中包括但不限于:

  • Statistical Inference 统计推断
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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Protein-protein network databases

The management of protein-protein interaction (PPI) data presents similar issues as those faced in other domains, i.e., PPI data need to be stored, exchanged, queried, and analyzed. PPI data are the constitutive building blocks for protein interaction networks (PINs). This section discusses main phases and issues of PPI data management [6].

Regarding PPI data storage, main efforts were devoted to the definition of standards for data exchange, such as HUPO PSI-MI, but currently, PPI data are stored as large sets of binary interactions, without taking into account XML-based languages and related XML databases. The storage of PPI data could exploit some already developed storage systems for other graph-based data, such as the triple stores used for storing RDF data or the emerging graph databases [4]. In graph databases, schema and instances are modeled as graphs, and data manipulation is expressed by graphoriented operations. A graph database proposal for genomics is reported, ${ }^9$ and a project for biochemical pathways is reported in [7].
Moreover, a naming mechanism to identify interactions in a unique way has not been yet been developed, and (binary) interactions are named by naming the interacting proteins.

Also, PPI data querying could benefit from semi-structured or graph databases as summarized below; existing PPI data offer only very simple retrieval mechanisms allowing the retrieval of proteins interacting with a target protein. Current PPI databases surveyed in this paper do not offer sophisticated query mechanisms based on graph manipulation, but, on the other hand, they con-stitute the only available structured repository for interaction data and allow an easy sharing and annotation of such data. Moreover, all the existing databases go beyond the storing of the interaction, but integrates it with functional annotations, sequence information and references to corresponding genes. Finally, they generally provide some visualization tools that presents a subset of interactions in a comprehensive graph.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|The human connectome project

The human connectome project (HCP) [27] is a big project that aims to provide the community with insight into brains related to connectivity, functions, and variability among individuals. HCP is an effort of more than 5 years based on a data acquisition plan and a subsequent pipeline of analysis held by a consortium of investigators. The HCP focuses a cohort of 1200 subjects (twins and their nontwin siblings) using multiple imaging modalities (i.e., diffusion imaging, functional MRI, weighted MRI, electroencephalography, behavioral and genetic data.

Bringing together multiple resonance imaging modalities from different laboratories has been one of the significant challenges of the HCP. Therefore they developed a template pipeline for acquiring and storing data described in [9]. The pipeline is based on a set of minimal preprocessing pipelines that must be followed by all the participants to accomplish many low-level tasks. This allows the data interchange and, more important, the possibility of an easy comparison among different connectomes, reducing both storage and processing requirements.

Starting from data of the human connectome project, Kerepesi et al. [18] computed structural connectomes of 426 human subjects. For each individual, they used five different resolution scales, yielding (83, 129, 234, 463, and 1015 nodes) and many edge weights. All data are available in the GraphML language for download and authors also provide anatomically relevant annotations. Authors also offer for a subset of subjects the anatomical classification of subgraphs for some region of interest of the brain.Authors also offer the community a set of tools for processing connectomes through the GitHub interface.

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网络分析代考

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Protein-protein network databases

蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 数据的管理与其他领域面临的问题类似,即 PPI 数据需要存储、交换、查询和分析。PPI 数据是蛋白质相互作用网络 (PIN) 的构成要素。本节讨论 PPI 数据管理的主要阶段和问题 [6]。

关于PPI数据存储,主要致力于数据交换标准的定义,如HUPO PSI-MI,但目前PPI数据存储为大集合二进制交互,没有考虑基于XML的语言和相关的XML数据库。PPI 数据的存储可以利用一些已经开发的存储系统来存储其他基于图形的数据,例如用于存储 RDF 数据的三重存储或新兴的图形数据库 [4]。在图数据库中,模式和实例被建模为图,数据操作由面向图的操作表示。报告了基因组学图数据库提案,9[7] 中报告了一个生化途径项目。
此外,尚未开发出以独特方式识别相互作用的命名机制,并且(二元)相互作用是通过命名相互作用的蛋白质来命名的。

此外,PPI 数据查询可以受益于半结构化或图形数据库,如下所述;现有的 PPI 数据仅提供非常简单的检索机制,允许检索与目标蛋白质相互作用的蛋白质。本文调查的当前 PPI 数据库不提供基于图形操作的复杂查询机制,但另一方面,它们构成了唯一可用的交互数据结构化存储库,并允许轻松共享和注释此类数据。此外,所有现有的数据库都超越了相互作用的存储,而是将其与功能注释、序列信息和对相应基因的引用相结合。最后,他们通常提供一些可视化工具,以综合图表的形式呈现交互的子集。

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|The human connectome project

人类连接组计划 (HCP) [27] 是一个大型项目,旨在让社区深入了解与个体之间的连接性、功能和可变性相关的大脑。HCP 是一项基于数据采集计划和随后由研究人员联盟进行的分析管道的 5 年多的努力。HCP 使用多种成像方式(即弥散成像、功能性 MRI、加权 MRI、脑电图、行为和遗传数据)聚焦 1200 名受试者(双胞胎及其非双胞胎兄弟姐妹)。

将来自不同实验室的多种共振成像模式结合在一起一直是 HCP 面临的重大挑战之一。因此,他们开发了一种模板管道,用于获取和存储 [9] 中描述的数据。流水线基于一组最小的预处理流水线,所有参与者都必须遵循这些流水线才能完成许多低级任务。这允许数据交换,更重要的是,可以轻松比较不同的连接组,从而减少存储和处理要求。

从人类连接组项目的数据开始,Kerepesi 等人。[18] 计算了 426 名人类受试者的结构连接体。对于每个人,他们使用了五种不同的分辨率尺度,产生(83、129、234、463 和 1015 个节点)和许多边缘权重。所有数据均以 GraphML 语言提供下载,作者还提供了解剖学相关的注释。作者还为一部分受试者提供了大脑某些感兴趣区域的子图的解剖学分类。作者还为社区提供了一组用于通过 GitHub 界面处理连接体的工具。

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

R语言代写问卷设计与分析代写
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网络分析研究实体之间的关系,如个人、组织或文件。在多个层面上操作,它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。

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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Biomolecular interaction network database

The biomolecular interaction network database $(\mathrm{BIND})^{11}[2]$ contains protein interactions annotated with molecular function information extracted from literature. It is based on three main types of data records: interaction, molecular complex, and pathway. An interaction record stores a description of the reaction event between two objects. Molecular complexes are stored through the use of interactions, temporally sorted, producing them. When the reactions generating a complex are unknown, the complex is defined more loosely. A pathway, defined as a network of interactions usually mediating some cellular functions, is described as a series of reactions with information, such as cell cycle and associated phenotypes.

The database permits different modes of search: using identifiers from other biological databases, or by using specific fields, such as literature information, molecule structure, and gene information, including functions. The extracted information can be displayed with a BIND interaction viewer. Networks are rendered as graphs, where nodes, representing molecules, are labeled with some ontological information.

The IntAct $[12]^{12}$ database is a database of interactions that is based completely on open-source software. It contains not only protein interactions data, but also DNA and molecular interaction data. IntAct uses a set of controlled vocabularies and ontologies to provide a semantically consistent annotation method. A researcher can submit an interaction, using the PSI-MI format [13], by sending an e-mail to the database curators.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|The human connectome project

The human connectome project (HCP) [27] is a big project that aims to provide the community with insight into brains related to connectivity, functions, and variability among individuals. HCP is an effort of more than 5 years based on a data acquisition plan and a subsequent pipeline of analysis held by a consortium of investigators. The HCP focuses a cohort of 1200 subjects (twins and their nontwin siblings) using multiple imaging modalities (i.e., diffusion imaging, functional MRI, weighted MRI, electroencephalography, behavioral and genetic data.

Bringing together multiple resonance imaging modalities from different laboratories has been one of the significant challenges of the HCP. Therefore they developed a template pipeline for acquiring and storing data described in [9]. The pipeline is based on a set of minimal preprocessing pipelines that must be followed by all the participants to accomplish many low-level tasks. This allows the data interchange and, more important, the possibility of an easy comparison among different connectomes, reducing both storage and processing requirements.

Starting from data of the human connectome project, Kerepesi et al. [18] computed structural connectomes of 426 human subjects. For each individual, they used five different resolution scales, yielding (83, 129, 234, 463, and 1015 nodes) and many edge weights. All data are available in the GraphML language for download and authors also provide anatomically relevant annotations. Authors also offer for a subset of subjects the anatomical classification of subgraphs for some region of interest of the brain.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|ESS2022

网络分析代考

统计代写|网络分析代写网络分析代考|生物分子相互作用网络数据库

生物分子相互作用网络数据库$(\mathrm{BIND})^{11}[2]$包含从文献中提取的注释了分子功能信息的蛋白质相互作用。它基于三种主要类型的数据记录:相互作用、分子复合体和途径。交互记录存储两个对象之间反应事件的描述。分子复合体是通过相互作用储存的,经过时间排序,产生它们。当生成络合物的反应未知时,络合物的定义就比较宽松。通路被定义为通常介导某些细胞功能的相互作用网络,它被描述为一系列与信息的反应,如细胞周期和相关表型


该数据库允许不同的搜索模式:使用来自其他生物数据库的标识符,或使用特定的字段,如文献信息、分子结构和基因信息(包括功能)。提取的信息可以用BIND交互查看器显示。网络以图的形式呈现,其中代表分子的节点被标记为一些本体信息


完整的$[12]^{12}$数据库是一个完全基于开源软件的交互数据库。它不仅包含蛋白质相互作用数据,还包含DNA和分子相互作用数据。integrity使用一组受控词汇表和本体来提供语义一致的注释方法。研究者可以通过向数据库管理员发送电子邮件,使用PSI-MI格式[13]提交一个交互

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|人类连接组项目

. The human connectome project


人类连接组项目(HCP)[27]是一个大型项目,旨在为社会提供与连接、功能和个体间可变性有关的大脑洞察。HCP是一个超过5年的工作,基于一个数据采集计划和后续的分析管道,由调查人员组成的联盟。HCP聚焦了1200名受试者(双胞胎和他们的非双胞胎兄弟姐妹),使用多种成像方式(即扩散成像、功能MRI、加权MRI、脑电图、行为和遗传数据)


汇集来自不同实验室的多种共振成像模式一直是HCP的重大挑战之一。因此,他们开发了一个用于获取和存储[9]中描述的数据的模板管道。该管道基于一组最小预处理管道,所有参与者必须遵循这些管道来完成许多低级任务。这允许数据交换,更重要的是,可以在不同的连接体之间进行容易的比较,从而减少存储和处理需求


Kerepesi et al.[18]从人类连接组项目的数据出发,计算了426个人类受试者的结构连接组。对于每个个体,他们使用五种不同的分辨率尺度,产生(83、129、234、463和1015个节点)和许多边的权重。所有数据都可以通过GraphML语言下载,作者还提供了解剖学相关的注释。作者还为一部分受试者提供了大脑某些感兴趣区域的子图的解剖分类

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

tatistics-lab作为专业的留学生服务机构,多年来已为美国、英国、加拿大、澳洲等留学热门地的学生提供专业的学术服务,包括但不限于Essay代写,Assignment代写,Dissertation代写,Report代写,小组作业代写,Proposal代写,Paper代写,Presentation代写,计算机作业代写,论文修改和润色,网课代做,exam代考等等。写作范围涵盖高中,本科,研究生等海外留学全阶段,辐射金融,经济学,会计学,审计学,管理学等全球99%专业科目。写作团队既有专业英语母语作者,也有海外名校硕博留学生,每位写作老师都拥有过硬的语言能力,专业的学科背景和学术写作经验。我们承诺100%原创,100%专业,100%准时,100%满意。

随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

R语言代写问卷设计与分析代写
PYTHON代写回归分析与线性模型代写
MATLAB代写方差分析与试验设计代写
STATA代写机器学习/统计学习代写
SPSS代写计量经济学代写
EVIEWS代写时间序列分析代写
EXCEL代写深度学习代写
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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CSE416a

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网络分析研究实体之间的关系,如个人、组织或文件。在多个层面上操作,它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。

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我们提供的网络分析Network Analysis及其相关学科的代写,服务范围广, 其中包括但不限于:

  • Statistical Inference 统计推断
  • Statistical Computing 统计计算
  • Advanced Probability Theory 高等概率论
  • Advanced Mathematical Statistics 高等数理统计学
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  • Statistical Machine Learning 统计机器学习
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  • Foundations of Data Science 数据科学基础
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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Genetic interaction network databases

The number of reported genetic interactions are relatively less in comparison to other biological networks. This may due to the involvement of various indirect factors that determine true physical interactions, and hence not possible to elucidate true relationship based on a single source of information. Majority of the interactions are predicted in silico and reported in the databases. Microarray and RNA sequence reads are the most popularly used data sources for predicting such interactions. However, they are sensitive towards the quality, reliability, and availability of the data. Also, the interactions largely depend on the merit of the inference method used. Below, we discuss a few databases dealing with gene-gene relationship networks.

Transcriptional regulatory relationships unraveled by sentence based text mining [10], is a database which consists of human and mouse transcriptional regulatory networks. It comprises of 8,444 and 6,552 TF-target regulatory relationships of 800 human TFs and 828 mouse TFs, respectively.Transcriptional regulatory element database [29], consists of a number of promoters and genes of human, mouse, and rat. This database focuses on GRN’s for each TF-target gene pairs involved in cancer. This database also consists of other features: it contains the genome-wide promoter annotation, gene transcriptional regulation. It also provides an interface, which is user-friendly for extraction of data for all the three species.

Biological general repository [26] for interaction datasets consists of interaction of 70 different organisms, such as the horse, tomato, and castor bean. This repository searches 71,178 for $1,753,686$ protein and genetic interactions, 28,093 chemical associations, and 874,796 posttranslational modifications from major model organism species.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Protein-protein network databases

The management of protein-protein interaction (PPI) data presents similar issues as those faced in other domains, i.e., PPI data need to be stored, exchanged, queried, and analyzed. PPI data are the constitutive building blocks for protein interaction networks (PINs). This section discusses main phases and issues of PPI data management [6].

Regarding PPI data storage, main efforts were devoted to the definition of standards for data exchange, such as HUPO PSI-MI, but currently, PPI data are stored as large sets of binary interactions, without taking into account XML-based languages and related XML databases. The storage of PPI data could exploit some already developed storage systems for other graph-based data, such as the triple stores used for storing RDF data or the emerging modeled as graphs, and data manipulation is expressed by graphoriented operations. A graph database proposal for genomics is reported, ${ }^9$ and a project for biochemical pathways is reported in [7].
Moreover, a naming mechanism to identify interactions in a unique way has not been yet been developed, and (binary) interactions are named by naming the interacting proteins.

Also, PPI data querying could benefit from semi-structured or graph databases as summarized below; existing PPI data offer only very simple retrieval mechanisms allowing the retrieval of proteins interacting with a target protein. Current PPI databases surveyed in this paper do not offer sophisticated query mechanisms based on graph manipulation, but, on the other hand, they con-stitute the only available structured repository for interaction data and allow an easy sharing and annotation of such data. Moreover, all the existing databases go beyond the storing of the interaction, but integrates it with functional annotations, sequence information and references to corresponding genes. Finally, they generally provide some visualization tools that presents a subset of interactions in a comprehensive graph.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CSE416a

网络分析代考

统计代写|网络分析代写网络分析代考|遗传相互作用网络数据库


与其他生物网络相比,报告的基因相互作用数量相对较少。这可能是由于涉及到各种间接因素,这些因素决定了真实的物理相互作用,因此不可能根据单一的信息来源来阐明真实的关系。大部分的相互作用都是在硅片中预测并在数据库中报告的。微阵列和RNA序列读取是预测这种相互作用最常用的数据源。然而,他们对数据的质量、可靠性和可用性很敏感。此外,相互作用在很大程度上取决于所使用的推理方法的优点。下面,我们将讨论一些处理基因-基因关系网络的数据库

基于句子的文本挖掘揭示的转录调控关系[10],是一个由人类和小鼠转录调控网络组成的数据库。它分别包括8,444和6,552个tgf -target调控关系,分别涉及800个人类tgf和828个小鼠tgf。转录调控元件数据库[29],由许多启动子和人类、小鼠和大鼠的基因组成。这个数据库关注的是参与癌症的每个tf -靶基因对的GRN。该数据库还包括其他特征:它包含全基因组启动子注释、基因转录调控。它还提供了一个用户友好的界面,用于提取所有三个物种的数据


交互数据集的生物通用存储库[26]包含70种不同生物的交互,如马、番茄和蓖麻豆。该知识库从主要的模式生物物种中搜索了71,178个$1,753,686$蛋白质和遗传相互作用,28,093个化学关联,以及874,796个翻译后修饰

统计代写|网络分析代写网络分析代考|蛋白质-蛋白质网络数据库

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蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据的管理与其他领域面临的问题相似,即PPI数据需要存储、交换、查询和分析。PPI数据是蛋白质相互作用网络(pin)的组成模块。本节讨论PPI数据管理的主要阶段和问题[6]


关于PPI数据存储,主要致力于定义数据交换标准,如HUPO PSI-MI,但目前,PPI数据存储为大型二进制交互集,没有考虑到基于XML的语言和相关的XML数据库。PPI数据的存储可以利用一些已经开发的存储系统,用于存储其他基于图的数据,例如用于存储RDF数据或新建模为图的三元存储,数据操作通过面向图的操作表示。报告了基因组学的图形数据库建议,${ }^9$和生物化学途径的项目在[7]中报告。此外,以一种独特的方式识别相互作用的命名机制还没有被开发出来,(二进制)相互作用是通过命名相互作用的蛋白质来命名的


此外,PPI数据查询可以从半结构化或图表数据库中受益,如下所述;现有的PPI数据只提供非常简单的检索机制,允许检索与目标蛋白相互作用的蛋白质。本文调查的当前PPI数据库没有提供基于图操作的复杂查询机制,但另一方面,它们构成了交互数据的唯一可用的结构化存储库,并允许轻松地共享和注释此类数据。此外,现有的所有数据库都超越了相互作用的存储,而是集成了功能注释、序列信息和相应基因的引用。最后,它们通常提供一些可视化工具,在一个全面的图中表示交互的子集

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

R语言代写问卷设计与分析代写
PYTHON代写回归分析与线性模型代写
MATLAB代写方差分析与试验设计代写
STATA代写机器学习/统计学习代写
SPSS代写计量经济学代写
EVIEWS代写时间序列分析代写
EXCEL代写深度学习代写
SQL代写各种数据建模与可视化代写

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CS224W

如果你也在 怎样代写网络分析Network Analysis这个学科遇到相关的难题,请随时右上角联系我们的24/7代写客服。

网络分析研究实体之间的关系,如个人、组织或文件。在多个层面上操作,它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。

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  • Statistical Inference 统计推断
  • Statistical Computing 统计计算
  • Advanced Probability Theory 高等概率论
  • Advanced Mathematical Statistics 高等数理统计学
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  • Foundations of Data Science 数据科学基础
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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|No-SQL and graph databases

Relational databases (RDB) were developed in the early 1970 s, and they rapidly became the standard for database management systems. RDBs are currently the best choice for modeling data with relational properties, whereas more recently the production of data with low structures and big dimensions (e.g., biological network data, social network data, and, in general, big data) is growing.

Consequently, the use of traditional RDB systems has some drawbacks, i.e., to obtain complex information from multiple relations, RDB sometimes needs to perform expensive SQL (Structured Query Language) join operation to merge two or more relations at the same time. To mitigate, besides traditional data storage format, other data storage formats have been proposed, often referred to as No-SQL (not only SQL) databases. There exist many different structures of No-SQL databases, such as key-value pairs, document-oriented, time series, and we focus in particular on graph databases [3].
Among the others, we focus here on graph databases (GdB), i.e., a database that uses a graph structure for expressing queries based on nodes, edges and properties for storing attributes related to nodes and edges. The core of a graph database model is the concept of graph used to associate data items stored as nodes using tips representing the relationship among them. Relationships link data together in an easy way, and it results faster data retrieval (i.e., with constant time in many cases).

In a GdB, nodes represent entities, such as proteins, biological molecules, people or patients. Each node may be seen as the translation of a row (or record) of a relational database. Similarly, edges connecting nodes represent relationships among two records, and they can either be directed or undirected. When graphs are directed, the direction of the edge represents, in general, a different meaning. In a GdB, edges constitute the key concept, since they represent an abstraction that is not representable easily in the relational model. Each node may have a set of asnociated properties, i.e., the GdB represents a protein interaction tein, cross-referenced to an external database and other biological information.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Pros and cons of using No-SQL databases

The pros and cons of using a graph database instead of relational databases is thus an important research area. Have and Jenses [11] compared the use of Neo4J databases concerning PostgreSQL on the human interaction network imported from the STRING database. The network used in the experiment has 20,140 proteins and $2.2$ million interactions.

Neo4J stores the edges as pointers between two nodes, thus enabling the traversal of nodes in constant time. Properties associated with nodes and edges (such as node name, confidence scores of interactions, source of communications, etc.) are stored together with nodes and edges, since Neo4J uses the property graph model. In such a model, data is organized as nodes, relationships, and properties (data stored on the nodes or relationships). Authors [11] stored the graph in PostgreSQL ${ }^7$ as a table of node pairs. or constant time based on the index used.

The comparison of databases has been made measuring the speed of Cypher and SQL queries for solving three problems:

  • finding immediate neighbors and their interactions,
  • finding the best scoring path between two proteins,
  • finding the shortest path between them.
    Authors measured a great speedup of No-SQL over a relational database. Despite this, it does not necessarily imply that the nonrelational databases are the best choice always. They note that when queries are formulated in terms of paths, then graph databases are more concise and clear. Conversely, relational databases are more evident when set operations are needed.
  • A plethora of databases is available publicly and privately, storing extensive biological experimental data maintained in various database formats. With the advent of high throughput experimental setup and advanced database technologies, it is now possible to generate, store, and access a high volume of experimental data in various repositories conveniently. Practical data analysis is now possible to elucidate previously unknown biological facts on applying various data analytic and inference tools on the stored data.
  • Next, we discuss few popularly used data sources for three biological networks: gene interactions, protein interactions, and brain connectomes.
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|CS224W

网络分析代考

统计代写|网络分析代写网络分析代考|No-SQL和图数据库


关系数据库(RDB)在20世纪70年代早期发展起来,并迅速成为数据库管理系统的标准。rdb是目前对具有关系属性的数据建模的最佳选择,而最近低结构和大维度数据(例如生物网络数据、社会网络数据,以及一般的大数据)的生产正在增长


因此,使用传统的RDB系统有一些缺点,例如,为了从多个关系中获取复杂的信息,RDB有时需要执行昂贵的SQL(结构化查询语言)连接操作来同时合并两个或多个关系。为了缓解这种情况,除了传统的数据存储格式外,还提出了其他的数据存储格式,通常称为No-SQL(不仅仅是SQL)数据库。No-SQL数据库有许多不同的结构,如键值对、面向文档的、时间序列,我们特别关注图数据库[3]。其中,我们关注的是图数据库(GdB),即使用图结构来表示基于节点、边和存储与节点和边相关的属性的查询的数据库。图数据库模型的核心是用来关联存储为节点的数据项的图的概念,这些数据项使用表示它们之间关系的提示。关系以一种简单的方式将数据链接在一起,它会导致更快的数据检索(例如,在许多情况下,恒定的时间)


在GdB中,节点表示实体,如蛋白质、生物分子、人或患者。每个节点都可以看作是关系数据库的一行(或记录)的翻译。类似地,连接节点的边表示两个记录之间的关系,它们可以是有向的,也可以是无向的。当图形有方向时,边的方向通常表示不同的含义。在GdB中,边构成了关键概念,因为它们表示在关系模型中不容易表示的抽象。每个节点可能有一组相关的属性,例如,GdB表示蛋白质相互作用tein,与外部数据库和其他生物信息交叉引用

统计代写|网络分析代写网络分析代考|使用No-SQL数据库的优缺点

.使用No-SQL数据库的优缺点


因此,使用图形数据库代替关系数据库的优缺点是一个重要的研究领域。Have和Jenses[11]比较了从STRING数据库导入的人机交互网络上关于PostgreSQL的Neo4J数据库的使用情况。实验中使用的网络有20140个蛋白质和$2.2$万个相互作用


Neo4J将边缘存储为两个节点之间的指针,从而支持在固定时间内遍历节点。与节点和边相关的属性(如节点名称、交互的置信度分数、通信源等)与节点和边一起存储,因为Neo4J使用属性图模型。在这样的模型中,数据被组织为节点、关系和属性(存储在节点或关系上的数据)。作者[11]将图作为节点对表存储在PostgreSQL ${ }^7$中。或基于所使用的索引的常数时间


对Cypher和SQL查询在解决三个问题时的速度进行了数据库的比较

  • 寻找相邻蛋白质及其相互作用,
  • 寻找两个蛋白质之间的最佳评分路径,
  • 寻找它们之间的最短路径。作者测量了No-SQL在关系数据库上的极大加速。尽管如此,这并不一定意味着非关系数据库总是最佳选择。他们指出,当查询以路径的形式表述时,图形数据库会更加简洁和清晰。相反,当需要集合操作时,关系数据库更加明显。大量的数据库可以公开和私下使用,存储着以各种数据库格式维护的大量生物实验数据。随着高吞吐量实验设置和先进的数据库技术的出现,现在可以在各种存储库中方便地生成、存储和访问大量的实验数据。通过对存储的数据应用各种数据分析和推理工具,实际的数据分析现在可以阐明以前未知的生物事实。

接下来,我们讨论三个生物网络:基因相互作用、蛋白质相互作用和大脑连接体的几个常用数据源

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

R语言代写问卷设计与分析代写
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统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|ESS2022

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网络分析研究实体之间的关系,如个人、组织或文件。在多个层面上操作,它描述并推断单个实体、实体的子集和整个网络的关系属性。

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  • Foundations of Data Science 数据科学基础
统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|ESS2022

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Array representation

The sequential representation of a graph using an array data structure uses a two-dimensional array or matrix called adjacency matrix.

Definition 2.2.1 (Adjacency matrix). Given a graph $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E})$, an adjacency matrix, say $A d j$ is a square matrix of size $|\mathcal{V}| \times|\mathcal{V}|$. Each cell of $A d j$ indicates an edge between any two vertices or nodes:
$$
A d j[i][j]= \begin{cases}\omega, & \text { if }\left(v_i, v_j\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E}) \ 0, & \text { otherwise }\end{cases}
$$
where $\omega$ is the weight of the edge between the nodes $v_i$ and $v_j$. In the case of an unweighted graph, $\omega$ is considered as 1, whereas for weighted graph it may be any value according to the problem in hand. See Fig. 2.10.

Adjacency matrices of undirected graphs are symmetric, where $A d j[i][j]=A d j[j][i]$, for $i, j$. In other words, we may say that $A d j$ and its transpose $A d j^{\prime}$ is the same. Unlike undirected graph, digraph produces asymmetric matrix.
Finding degree of a node
One of the important operations on a graph is finding the degree of a given node. From the adjacency matrix, it is easy to determine the connection of any nodes. The degree of a node in an undirected graph can be calculated as follows:
$$
\operatorname{deg}\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n A d j[i][j],
$$

where values in the $i^{t h}$ row in the adjacency matrix indicates the connections to $n$ different nodes from the node $i$ in the graph. Similarly, in the case of digraph, the indegree and outdegree of a node can be calculated as follows:
$$
\text { indeg }\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[j][i] \text { and outdeg }\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j] \text {. }
$$

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|List representation

Array data structures are easy to access and fast in traversing. However, for a large graph, it is not always feasible to use adjacency matrix representation, due to large memory requirements. It is even more ineffective if a graph contains more nodes with relatively few connections or edges (sparse graph); this leads to the formation of a sparse matrix. To overcome such situation, list representation is an effective alternative for memory representation of large and dense graphs. An advantage of list representation is that it can be used for dynamic graphs, where vertices and edges are growing and shrinking with time. It is commonly implemented in any programming languages as an array of a singly-linked list. The size of the array is the number of vertices in the graph. Each singly linked list keeps track of the neighbors of a vertex. In the case of a weighted graph, the weights of an edge between a pair of vertices are stored in the nodes of singly-linked list itself as a separate entry together with vertex level. It is easy to calculate the degree of a vertex by looking into the number of nodes in the list of the vertex. For example, the degree of the vertex $\mathbf{C}$, which is four (04), can easily be calculated by finding the length of the list headed by $\mathrm{C}$, as given in Fig. $2.11$.

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|ESS2022

网络分析代考

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|Array representation

使用数组数据结构的图的顺序表示使用称为邻接矩阵的二维数组或矩阵。
定义 2.2.1 (邻接矩阵) 。给定一张图 $\mathcal{G}=(\mathcal{V}, \mathcal{E})$ ,邻接矩阵,说 $A d j$ 是一个大小的方阵 $|\mathcal{V}| \times|\mathcal{V}|$. 的每个细胞 $\operatorname{Adj}$ 表示任意两个顶点或节点之间的边:
$$
\operatorname{Adj}[i][j]=\left{\omega, \quad \text { if }\left(v_i, v_j\right) \in \mathcal{G}(\mathcal{E}) 0, \quad\right. \text { otherwise }
$$
在哪里 $\omega$ 是节点之间边的权重 $v_i$ 和 $v_j$. 在末加权图的情况下, $\omega$ 被认为是 1,而对于加权图,它可以是根据手头问 题的任何值。见图 2.10。
无向图的邻接矩阵是对称的,其中 $A d j[i][j]=A d j[j][i]$ ,为了i, $j$. 换句话说,我们可以说 $A d j$ 及其转置 $A d j^{\prime}$ 是一样的。与无向图不同,有向图产生非对称矩阵。
求节点
的度数图上的重要操作之一是求给定节点的度数。从邻接矩阵中,很容易确定任何节点的连接。无向图中节点的 度数可以计算如下:
$$
\operatorname{deg}\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j],
$$
其中的值 $i^{t h}$ 令接矩阵中的行表示与 $n$ 与节点不同的节点 $i$ 在图中。同样,在有向图的情况下,节点的入度和出度可 以计算如下:
$$
\operatorname{indeg}\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[j][i] \text { and outdeg }\left(v_i\right)=\sum_{j=1}^n \operatorname{Adj}[i][j] \text {. }
$$

统计代写|网络分析代写Network Analysis代考|List representation

数组数据结构易于访问且遍历速度快。但是,对于大型图,由于内存需求大,使用邻接矩阵表示并不总是可行的。如果一个图包含更多节点而连接或边相对较少(稀疏图),则效率更高;这导致了稀疏矩阵的形成。为了克服这种情况,列表表示是大型和密集图的内存表示的有效替代方案。列表表示的一个优点是它可以用于动态图,其中顶点和边随时间增长和缩小。它通常在任何编程语言中实现为单链表数组。数组的大小是图中的顶点数。每个单链表跟踪一个顶点的邻居。在加权图的情况下,一对顶点之间的边的权重与顶点级别一起作为单独的条目存储在单链表本身的节点中。通过查看顶点列表中的节点数可以很容易地计算出顶点的度数。例如,顶点的度数C,即四 (04),可以通过查找以C,如图所示。2.11.

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金融工程代写

金融工程是使用数学技术来解决金融问题。金融工程使用计算机科学、统计学、经济学和应用数学领域的工具和知识来解决当前的金融问题,以及设计新的和创新的金融产品。

非参数统计代写

非参数统计指的是一种统计方法,其中不假设数据来自于由少数参数决定的规定模型;这种模型的例子包括正态分布模型和线性回归模型。

广义线性模型代考

广义线性模型(GLM)归属统计学领域,是一种应用灵活的线性回归模型。该模型允许因变量的偏差分布有除了正态分布之外的其它分布。

术语 广义线性模型(GLM)通常是指给定连续和/或分类预测因素的连续响应变量的常规线性回归模型。它包括多元线性回归,以及方差分析和方差分析(仅含固定效应)。

有限元方法代写

有限元方法(FEM)是一种流行的方法,用于数值解决工程和数学建模中出现的微分方程。典型的问题领域包括结构分析、传热、流体流动、质量运输和电磁势等传统领域。

有限元是一种通用的数值方法,用于解决两个或三个空间变量的偏微分方程(即一些边界值问题)。为了解决一个问题,有限元将一个大系统细分为更小、更简单的部分,称为有限元。这是通过在空间维度上的特定空间离散化来实现的,它是通过构建对象的网格来实现的:用于求解的数值域,它有有限数量的点。边界值问题的有限元方法表述最终导致一个代数方程组。该方法在域上对未知函数进行逼近。[1] 然后将模拟这些有限元的简单方程组合成一个更大的方程系统,以模拟整个问题。然后,有限元通过变化微积分使相关的误差函数最小化来逼近一个解决方案。

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随机分析代写


随机微积分是数学的一个分支,对随机过程进行操作。它允许为随机过程的积分定义一个关于随机过程的一致的积分理论。这个领域是由日本数学家伊藤清在第二次世界大战期间创建并开始的。

时间序列分析代写

随机过程,是依赖于参数的一组随机变量的全体,参数通常是时间。 随机变量是随机现象的数量表现,其时间序列是一组按照时间发生先后顺序进行排列的数据点序列。通常一组时间序列的时间间隔为一恒定值(如1秒,5分钟,12小时,7天,1年),因此时间序列可以作为离散时间数据进行分析处理。研究时间序列数据的意义在于现实中,往往需要研究某个事物其随时间发展变化的规律。这就需要通过研究该事物过去发展的历史记录,以得到其自身发展的规律。

回归分析代写

多元回归分析渐进(Multiple Regression Analysis Asymptotics)属于计量经济学领域,主要是一种数学上的统计分析方法,可以分析复杂情况下各影响因素的数学关系,在自然科学、社会和经济学等多个领域内应用广泛。

MATLAB代写

MATLAB 是一种用于技术计算的高性能语言。它将计算、可视化和编程集成在一个易于使用的环境中,其中问题和解决方案以熟悉的数学符号表示。典型用途包括:数学和计算算法开发建模、仿真和原型制作数据分析、探索和可视化科学和工程图形应用程序开发,包括图形用户界面构建MATLAB 是一个交互式系统,其基本数据元素是一个不需要维度的数组。这使您可以解决许多技术计算问题,尤其是那些具有矩阵和向量公式的问题,而只需用 C 或 Fortran 等标量非交互式语言编写程序所需的时间的一小部分。MATLAB 名称代表矩阵实验室。MATLAB 最初的编写目的是提供对由 LINPACK 和 EISPACK 项目开发的矩阵软件的轻松访问,这两个项目共同代表了矩阵计算软件的最新技术。MATLAB 经过多年的发展,得到了许多用户的投入。在大学环境中,它是数学、工程和科学入门和高级课程的标准教学工具。在工业领域,MATLAB 是高效研究、开发和分析的首选工具。MATLAB 具有一系列称为工具箱的特定于应用程序的解决方案。对于大多数 MATLAB 用户来说非常重要,工具箱允许您学习应用专业技术。工具箱是 MATLAB 函数(M 文件)的综合集合,可扩展 MATLAB 环境以解决特定类别的问题。可用工具箱的领域包括信号处理、控制系统、神经网络、模糊逻辑、小波、仿真等。

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